Сам столкнулся с такой проблемой.
Скорее всего - было проведено межевание земельного участка.
Например было 6 соток (600), а стало 597... или 605..., или любое иное значение (допускается плюс/минус 10%).
Собственники земельных участков как правило сдают дискету (оптический диск) от кадастрового инженера после межевания в МФЦ (написав заявление на уточнение площади земельного участка) и на этом останавливаются, так как им действительно вносят эти изменения бесплатно (но только в ГКН).
При этом, если измеренная вновь кадастровым инженером площадь земельного участка отличается от площади в записи ЕГРП - вносится запись в "особые отметки", что "Сведения о площади помещения имеют статус «Актуальные незасвидетельствованные». Право зарегистрировано на объект с площадью [та площадь, которая ранее стояла в ЕГРП].
Чтобы это исправить (если планируется какая-либо сделка с этим земельным участком), правообладателю необходимо в МФЦ написать заявление о внесении изменений в записи реестра прав, ограничений и обременений недвижимого имущества Единого государственного реестра недвижимости, а именно на изменении площади земельного участка, приложить НОВУЮ, с новой метражностью участка полную кадастровую выписку (которую Вам выдали после того... через 10 дней, как Вы отдали в МФЦ дискету от кадастрового инженера), оплатить при этом гос.пошлину 350 рублей, и ждать еще 10 дней.
Если государственный регистратор посчитает внесённые в кадастр изменения законными, то запись из "особых отметок" удалят через 10 дней.
Любые сделки с подобными земельными участками возможны только после того, как эту запись из "особых отметок" удалят.

Еще раз повторю, что сам столкнулся с такой проблемой.
На данный момент межевание земельного участка у нас в российских законах приравнено к незаконной перепланировке.
Вот почитайте, что пишет Росреестр по этому поводу:

внешняя ссылка

внешняя ссылка